Investigadores del Departamento de Lenguajes y Ciencias de la Computación de la Universidad de Málaga (UMA), junto con la Unidad de Oncología de los Hospitales Universitarios Regional y Virgen de la Victoria de Málaga y el Instituto de Investigaciones Biomédicas (Ibima) de Málaga, han desarrollado una aplicación informática que permite obtener datos clínicos de enfermos de melanoma de forma simple y rápida.

A partir de bases de datos genéticas de pacientes, han diseñado una nueva herramienta que integra esta información existente y mejora la visualización de datos a los facultativos. Con ello, es posible obtener patrones de los afectados de esta enfermedad de la piel y comparar evoluciones de la enfermedad en distintos casos, según ha explicado la Fundación Descubre en una nota de prensa.

Genes para comprobar la evolución de la enfermedad

La solución propuesta se basa, en primer lugar, en un filtrado de genes procedentes de pacientes. Esto permite seleccionar los que representan el estado en el que se encuentra la enfermedad o la evolución de ésta.

Una vez filtrados estos genes más característicos, se ofrece una visualización a través de un mapa de calor, que permite diferenciar por colores aquellos genes que se comportan de forma similar. De esta forma, el experto puede observarlos mejor y establecer coincidencias en enfermos que han tenido una historia clínica similar. Estas similitudes sirven de pista inicial para establecer indicadores de la evolución de los afectados.

Un mapa de calor permite diferenciar por colores aquellos genes que se comportan de forma similar

El segundo tipo de análisis implementado en la aplicación es un gráfico que muestra los genes que están relacionados por expresarse de forma similar a lo largo de una serie temporal.

Según apuntan los expertos, este trabajo consigue principalmente realizar un análisis inicial más efectivo de los datos que se tienen disponibles y ponerlos al alcance de los investigadores clínicos.

"Existía ya un software específico de análisis de los datos, pero sólo orientado a genetistas o expertos en bioinformática. Es por ello que hemos desarrollado una herramienta simple, que permite al investigador clínico acometer una primera exploración de los datos de expresión, para detectar patrones o genes de interés en el ensayo clínico", ha explicado el investigador, Ismael Navas Delgado a la Fundación Descubre.

En el estudio titulado 'VIGLA-M: visual gene expression data analytics', publicado en la revista BMC Bioinformatics, ha utilizado como punto de partida una base de datos anónimos de pacientes que participan en este ensayo clínico de los cuales han almacenado varias muestras a lo largo del tratamiento que siguen.

Existía ya un software específico de análisis de los datos, pero sólo orientado a genetistas o expertos en bioinformática

En cada muestra, se analizan 770 genes, de los que se obtiene el nivel de expresión y, con ello, la respuesta al tratamiento que están obteniendo. Así, la nueva aplicación es capaz de reducir las muestras a unos seis genes más representativos de los pacientes, que es lo que permite la simplicidad de datos para su posterior revisión clínica.