La Hermandad del Museo, de origen gremial, fue creada por los plateros de la ciudad de San Andrés en 1575. Tan sólo dos años después pasa al Convento de la Merced, actual Museo de Bellas Artes. La Virgen de las Aguas formaba misterio con el cristo hasta la Semana Santa de 1922, cuando aconteció la primera salida bajo palio de esta Dolorosa.
El Museo fue la primera cofradía en salir un Lunes Santo, lo que ocurrió en 1923. Anteriormente cumplía la estación de penitencia los Viernes Santos.
Cuenta con dos pasos muy completos. Las esmeraldas de la cruz pectoral de la Virgen son colombianas, donadas por una hermana y están fechadas en el siglo XVIII. Impresiona la logradísima expresividad del crucificado. Cada año salen más de cien monaguillos en cada paso. La Virgen de las Aguas es la patrona de Emasesa, la empresa metropolitana de aguas de Sevilla.
| CRUZ DE GUÍA | PALIO | |
| 20:30 | Salida (20:35) | |
| 21:00 | Pl. Museo | Salida (21:15) |
| 21:30 | Alfonso XII | Pl. Museo |
| 22:00 | Campana (22:09) | Alfonso XII |
| 22:30 | Plaza (22:49) | Campana (22:50) |
| 23:00 | P. San Miguel (23:15) | Plaza (23:30) |
| 23:30 | P. Palos (23:34) | P. San Miguel (23:56) |
| 00:00 | García de Vinuesa | P. Palos (0:15) |
| 00:30 | Castelar | Alemanes |
| 01:00 | Pl. Molviedro | Castelar |
| 01:30 | Zaragoza | Pl. Molviedro |
| 02:00 | Gravina | Zaragoza |
| 02:30 | Entrada | Gravina |
| 03:00 | Entrada (3:15) |
